Sư thế danh là Bùi Thanh Đàm, sinh năm 1840 tại tổng Quang Liệt, huyện Thanh Trì, phủ Thường Tín, tỉnh Hà Nội (nay thuộc xã Thanh Liệt, huyện Thanh Trì, thành phố Hà Nội). Năm lên 10 tuổi, Sư xuất gia với hòa thượng họ Nguyễn ở chùa Hòe Nhai, Hà Nội.

Năm 18 tuổi Sư được gửi lên chùa Vĩnh Nghiêm tu học với hòa thượng Thích Tâm Viên, năm 20 tuổi được thọ giới Tỳ-kheo tại chùa này. Năm 1900, Sư huynh của Ngài là hòa thượng Thích Thanh Tuyền viên tịch, Ngài được sơn môn cử lên làm trụ trì chùa, từ đó được gọi là Tổ Vĩnh Nghiêm.

Năm 1934, Bắc Kỳ Phật giáo hội được thành lập, Ngài được thỉnh cầu làm Thiền Gia pháp chủ đầu tiên.

Năm 1936, Ngài viên tịch nhằm ngày mùng 8 tháng 12, trụ thế 96 năm, trải 86 năm tu hành.